自嘉庆以后，已由康乾鼎盛时期逐渐呈现出衰落状态。由于残酷的压迫和镇压人民，激起了一系列的起义和反抗。同治初年，响应太平军和稔军而兴起的陕西、甘肃的回民反清运动，就是当时广大回民为了争取生存权利的一次极其激烈的斗争。其规模之大、范围之广、时间之长，在整个西北都是罕见的。